Das bajoranische System war zu dem Zeitpunkt als er Commander war weder ein Ort der Föderation, noch war DS9 eine Föderationsbasis. Anfangs wusste man ja noch nichtmal vom Wurmloch. Da wollte man für diesen ziemlich unwichtigen Posten wohl keinen bedeutenden Offizier abstellen. Als dann (zugegebenermaßen sehr schnell) das Wurmloch entdeckt wurde, hat man es halt so belassen. Vermutlich hatte er freunde im HQ.
Fraglich wurde es erst mit dem Dominion Krieg, da hätte ein Admiral durchaus Sinn gemacht als Kommandant der Basis am Ende des feindlich genutzten Wurmlochs. Zu dem Zeitpunkt hat er sich aber schon soweit als Experte des Dominions bewährt, dass er als Captain ausreichte und man keinen RDML eingesetzt hat. Vor allem da sowieso mit VADM Ross ein höhergestellter Kommandant des Sektors vorhanden war. Ein Austausch von Sisko wär aber wie gesagt möglich gewesen.
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